3-环己胺基丙磺酸可以作生物缓冲剂，用在生化诊断试剂盒、DNA/RNA提取试剂盒及PCR诊断试剂盒里以及于酶化学及HPLC分离碱性药物的缓冲液。CAPS缓冲液由CAPS、去离子水等组成，调pH至11.0，用于纤连蛋白的纯化。
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