焦碳酸二乙酯是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂,分子式为C6H10O5,分子量为162.14。通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性,常用于生物实验中RNA的提取等。
DEPC是RNA酶的化学修饰剂,它和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性。DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。
DEPC是一种有效的核酸酶抑制剂,它能够与很多酶的-NH,-SH或-OH等基团发生反应,从而破坏酶的活性中心。DEPC溶液浓度约为0.1%(v/v)时可使RNase失活,从而防止RNA被降解。在进行RNA实验时,常用DEPC处理实验所用的各种试剂。
我们通常所说的DEPC(处理)水是指用DEPC处理过并经高温高压消毒的超纯水。超纯水加0.1%DEPC,混匀过夜,121℃,20min。而后DEPC即降解成二氧化碳和酒精,失去毒性。
DEPC(处理)水可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各种反应体系如反转录、siRNA的退火等,以及其它各种要求无RNase、DNase和proteinase的反应体系。
DEPC有刺激性,对眼睛和气道粘膜有强刺激,在操作中应尽量在通风的条件下进行,DEPC毒性并不是很强,但吸入的毒性最强。
DEPC是一种潜在的致癌物质,主要是能生成乙酯基衍生物和乙酯类衍生物,其中尿烷是一种已知的致癌物质。